En raison de la perte de rayonnement IR, presque tous les instruments à thermopiles ont généralement un décalage négatif. Ce décalage est le plus facilement visible la nuit, quand une petite valeur négative est lue au lieu de zéro. Ce même décalage est présent pendant la journée, mais il n'est pas aussi visible à cause de l'importance du signal solaire.
Un autre problème commun concerne la mise à niveau d'un instrument. La mise à niveau d'un instrument de thermopile peut entraîner des erreurs dans la composante du faisceau direct car la réponse en cosinus n'est pas correcte. Ces erreurs sont plus notables lorsque le soleil est proche de l'horizon car l'angle est peu profond.