Le ré-étalonnage d'usine est effectué selon les besoins. Lorsque les indicateurs de diagnostic commencent à apparaître et persistent, même après avoir nettoyé l'analyseur et en vérifiant ses paramètres, un ré-étalonnage est nécessaire. En outre, si la performance de l'analyseur s'est dégradée, un ré-étalonnage est recommandé.
Un test de performance consiste à vérifier la dérive absolue du signal au cours d'une année. Une dérive de quelques pour cent par année est normale. Si la dérive annuelle du signal est excessive ou si la puissance du signal est inférieure à 0,7 lorsque les fenêtres sont nettes, un ré-étalonnage en usine est nécessaire. En outre, si le rapport de la puissance du signal CO2 à H2O n'est pas proche d'un, il peut également être temps de réaliser un ré-étalonnage en usine.